分支系统学

2020-10-16

2020-10-16
系统发育树

  系统发育树又名分子进化树,是生物信息学中描述不同生物之间相关关系的方法。通过系统学分类分析,可以帮助了解生物的进化历史过程。

  主要分为有根树和无根树,有根树是有方向的树,包含唯一的节点,将其作为树中所有物种的共同祖先,反映了树上物种或基因的时间顺序。无根树只是指明了种属的相互关系,没有确认共同祖先或进化途径。

1 加载包

  系统发育树是研究物种进化历史必不可少的信息,可以利用它反映一些重要历史线索,如:

  1.生物多样性(物种形成或灭绝);

  2.物种性状进化与多样化(Character evolution and diversification);

  3.生物地理学(研究动植物的地理分布);

3 本章汇总

参数 类别 功能
load 函数包 load()函数将.Rdata文件数据加载到R中
RColorBrewer 函数包 加载调色版包